Этот баг встречается у многих. Листаешь фотки, особенно старые, и видишь вместо их миниатюр пустые серые квадраты.
Решение очень простое.
1. Выделяем серые квадраты, нажимаем на значок «Поделиться», затем «Дублировать». Создаются дубликаты с нормальными миниатюрами.

2. Удаляем пустые миниатюры.
Готово.

Из минусов – сбивается порядок во вкладке «Альбомы»: система распознает дубликаты как новые фотки. Но в «Моментах» с сортировкой все хорошо.
Я – перфекционист, и не хочу нарушать порядок фотографий
Ок.
1. Нажимаем на серый квадрат. Открывается фотка. Жмем на значок «Редактировать».

2. Выбираем любой эффект и применяем его, нажав на «Готово». Окно редактирования закроется.

3. Снова переходим в режим редактирования, нажимаем «Вернуть» и возвращаем фотографию к оригиналу.
После этого миниатюра отображается корректно.

И так с каждой фоткой, да. Спасибо, Apple.

Так это нормальное поведение. Обьем памяти устройства, даже если установить 1ТБ – не резиновый. Достаточно оставить открытым экран на миниатюрах и через какое-то время, система их перерисует (обычно я так видел в своих фотографиях).
Объём памяти в моем случае был не при делах. ? Системный глюк после восстановления из бэкапа.
@Эдуард Саркисян, Это не системный глюк. Миниатюры не сохраняются в бекап. Отложите свой телефон в сторону и вскоре все миниатюры будут снова созданы.
По наводке первого комментатора оставил iPhone на пол часа с включённым экраном на пустых миниатюрах, ничего не произошло.
А с момента бэкапа прошло более, чем пол года.
Видимо, разные проблемы, но со схожим визуально результатом.